Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM71Q2Q1W2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms