Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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