Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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