Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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