Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP6Q16828 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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