Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPROQ16827 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPROQ16827 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPROQ16827 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPROQ16827 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPROQ16827 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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