Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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