Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME3Q16798 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME3Q16798 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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