Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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