Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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