Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYTH1Q15438 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYTH1Q15438 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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