Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms