Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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