Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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