Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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