Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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