Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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