Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GAPVD1Q14C86 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAPVD1Q14C86 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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