Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IHHQ14623 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IHHQ14623 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms