Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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