Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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