Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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