Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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