Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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