Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRSQ13332 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PTPRSQ13332 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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