Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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