Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms