Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD47Q08722 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms