Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TYRO3Q06418 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms