Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms