Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms