Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHDQ02161 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHDQ02161 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHDQ02161 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms