Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms