Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL13RA1P78552 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms