Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX6P78412 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms