Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms