Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms