Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP1S1P61966 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP1S1P61966 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms