Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms