Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms