Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms