Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP7P55210 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms