Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms