Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIA4P48058 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms