Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPR4P46093 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPR4P46093 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPR4P46093 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPR4P46093 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPR4P46093 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPR4P46093 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPR4P46093 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms