Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms