Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms