Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC26A3P40879 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms