Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL1P40616 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL1P40616 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL1P40616 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms