Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA5P31644 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms